Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFAP221Q4G0U5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CFAP221Q4G0U5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP221Q4G0U5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP221Q4G0U5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP221Q4G0U5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP221Q4G0U5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP221Q4G0U5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP221Q4G0U5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP221Q4G0U5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP221Q4G0U5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP221Q4G0U5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP221Q4G0U5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP221Q4G0U5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP221Q4G0U5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP221Q4G0U5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP221Q4G0U5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP221Q4G0U5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP221Q4G0U5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP221Q4G0U5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP221Q4G0U5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP221Q4G0U5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP221Q4G0U5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP221Q4G0U5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP221Q4G0U5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP221Q4G0U5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP221Q4G0U5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP221Q4G0U5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP221Q4G0U5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP221Q4G0U5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP221Q4G0U5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP221Q4G0U5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP221Q4G0U5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP221Q4G0U5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP221Q4G0U5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP221Q4G0U5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFAP221Q4G0U5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFAP221Q4G0U5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFAP221Q4G0U5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFAP221Q4G0U5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFAP221Q4G0U5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CFAP221Q4G0U5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFAP221Q4G0U5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFAP221Q4G0U5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CFAP221Q4G0U5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP221Q4G0U5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP221Q4G0U5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP221Q4G0U5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP221Q4G0U5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP221Q4G0U5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP221Q4G0U5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP221Q4G0U5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP221Q4G0U5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP221Q4G0U5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP221Q4G0U5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP221Q4G0U5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms