Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LONRF3Q496Y0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LONRF3Q496Y0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LONRF3Q496Y0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LONRF3Q496Y0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LONRF3Q496Y0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LONRF3Q496Y0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LONRF3Q496Y0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LONRF3Q496Y0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LONRF3Q496Y0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LONRF3Q496Y0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LONRF3Q496Y0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LONRF3Q496Y0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LONRF3Q496Y0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LONRF3Q496Y0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LONRF3Q496Y0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LONRF3Q496Y0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LONRF3Q496Y0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LONRF3Q496Y0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LONRF3Q496Y0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LONRF3Q496Y0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LONRF3Q496Y0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LONRF3Q496Y0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LONRF3Q496Y0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LONRF3Q496Y0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LONRF3Q496Y0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LONRF3Q496Y0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LONRF3Q496Y0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LONRF3Q496Y0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LONRF3Q496Y0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms