Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RNF212Q495C1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms