Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00303Q3SY05 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LINC00303Q3SY05 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LINC00303Q3SY05 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00303Q3SY05 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00303Q3SY05 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms