Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NBPF1Q3BBV0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NBPF1Q3BBV0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NBPF1Q3BBV0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NBPF1Q3BBV0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NBPF1Q3BBV0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NBPF1Q3BBV0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NBPF1Q3BBV0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
NBPF1Q3BBV0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
NBPF1Q3BBV0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NBPF1Q3BBV0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NBPF1Q3BBV0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NBPF1Q3BBV0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
NBPF1Q3BBV0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NBPF1Q3BBV0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NBPF1Q3BBV0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
NBPF1Q3BBV0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NBPF1Q3BBV0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NBPF1Q3BBV0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NBPF1Q3BBV0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NBPF1Q3BBV0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NBPF1Q3BBV0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NBPF1Q3BBV0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NBPF1Q3BBV0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
NBPF1Q3BBV0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NBPF1Q3BBV0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NBPF1Q3BBV0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NBPF1Q3BBV0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
NBPF1Q3BBV0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NBPF1Q3BBV0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
NBPF1Q3BBV0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NBPF1Q3BBV0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NBPF1Q3BBV0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NBPF1Q3BBV0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NBPF1Q3BBV0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
NBPF1Q3BBV0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NBPF1Q3BBV0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NBPF1Q3BBV0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NBPF1Q3BBV0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NBPF1Q3BBV0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NBPF1Q3BBV0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NBPF1Q3BBV0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NBPF1Q3BBV0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NBPF1Q3BBV0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NBPF1Q3BBV0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NBPF1Q3BBV0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NBPF1Q3BBV0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NBPF1Q3BBV0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NBPF1Q3BBV0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NBPF1Q3BBV0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
NBPF1Q3BBV0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NBPF1Q3BBV0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NBPF1Q3BBV0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NBPF1Q3BBV0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NBPF1Q3BBV0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NBPF1Q3BBV0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NBPF1Q3BBV0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NBPF1Q3BBV0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NBPF1Q3BBV0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NBPF1Q3BBV0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NBPF1Q3BBV0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NBPF1Q3BBV0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
NBPF1Q3BBV0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NBPF1Q3BBV0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NBPF1Q3BBV0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NBPF1Q3BBV0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NBPF1Q3BBV0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NBPF1Q3BBV0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NBPF1Q3BBV0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NBPF1Q3BBV0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NBPF1Q3BBV0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NBPF1Q3BBV0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NBPF1Q3BBV0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NBPF1Q3BBV0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NBPF1Q3BBV0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NBPF1Q3BBV0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NBPF1Q3BBV0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NBPF1Q3BBV0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NBPF1Q3BBV0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NBPF1Q3BBV0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
NBPF1Q3BBV0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NBPF1Q3BBV0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NBPF1Q3BBV0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NBPF1Q3BBV0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NBPF1Q3BBV0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NBPF1Q3BBV0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NBPF1Q3BBV0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NBPF1Q3BBV0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NBPF1Q3BBV0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NBPF1Q3BBV0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NBPF1Q3BBV0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NBPF1Q3BBV0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
NBPF1Q3BBV0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NBPF1Q3BBV0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NBPF1Q3BBV0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
NBPF1Q3BBV0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NBPF1Q3BBV0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
NBPF1Q3BBV0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
NBPF1Q3BBV0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
NBPF1Q3BBV0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms