Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HFEQ30201 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HFEQ30201 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HFEQ30201 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HFEQ30201 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HFEQ30201 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HFEQ30201 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HFEQ30201 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HFEQ30201 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HFEQ30201 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HFEQ30201 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HFEQ30201 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HFEQ30201 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HFEQ30201 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HFEQ30201 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HFEQ30201 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HFEQ30201 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HFEQ30201 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HFEQ30201 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HFEQ30201 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HFEQ30201 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HFEQ30201 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HFEQ30201 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HFEQ30201 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HFEQ30201 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HFEQ30201 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HFEQ30201 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HFEQ30201 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HFEQ30201 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HFEQ30201 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HFEQ30201 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HFEQ30201 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HFEQ30201 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HFEQ30201 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HFEQ30201 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HFEQ30201 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HFEQ30201 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HFEQ30201 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HFEQ30201 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HFEQ30201 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HFEQ30201 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HFEQ30201 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HFEQ30201 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HFEQ30201 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HFEQ30201 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HFEQ30201 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HFEQ30201 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HFEQ30201 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HFEQ30201 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HFEQ30201 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HFEQ30201 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HFEQ30201 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HFEQ30201 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HFEQ30201 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HFEQ30201 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HFEQ30201 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HFEQ30201 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HFEQ30201 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HFEQ30201 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HFEQ30201 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HFEQ30201 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HFEQ30201 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HFEQ30201 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HFEQ30201 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HFEQ30201 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HFEQ30201 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HFEQ30201 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HFEQ30201 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HFEQ30201 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HFEQ30201 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HFEQ30201 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HFEQ30201 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HFEQ30201 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HFEQ30201 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HFEQ30201 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HFEQ30201 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HFEQ30201 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HFEQ30201 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HFEQ30201 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HFEQ30201 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HFEQ30201 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HFEQ30201 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HFEQ30201 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HFEQ30201 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HFEQ30201 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HFEQ30201 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HFEQ30201 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HFEQ30201 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HFEQ30201 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HFEQ30201 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HFEQ30201 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HFEQ30201 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HFEQ30201 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HFEQ30201 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HFEQ30201 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HFEQ30201 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HFEQ30201 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HFEQ30201 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HFEQ30201 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HFEQ30201 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms