Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM71Q2Q1W2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM71Q2Q1W2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM71Q2Q1W2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM71Q2Q1W2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM71Q2Q1W2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM71Q2Q1W2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM71Q2Q1W2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM71Q2Q1W2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM71Q2Q1W2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM71Q2Q1W2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM71Q2Q1W2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM71Q2Q1W2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM71Q2Q1W2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM71Q2Q1W2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM71Q2Q1W2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM71Q2Q1W2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM71Q2Q1W2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM71Q2Q1W2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM71Q2Q1W2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM71Q2Q1W2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM71Q2Q1W2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM71Q2Q1W2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM71Q2Q1W2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM71Q2Q1W2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIM71Q2Q1W2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM71Q2Q1W2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM71Q2Q1W2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM71Q2Q1W2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM71Q2Q1W2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM71Q2Q1W2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM71Q2Q1W2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM71Q2Q1W2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM71Q2Q1W2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM71Q2Q1W2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM71Q2Q1W2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM71Q2Q1W2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM71Q2Q1W2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM71Q2Q1W2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM71Q2Q1W2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM71Q2Q1W2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM71Q2Q1W2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM71Q2Q1W2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM71Q2Q1W2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM71Q2Q1W2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM71Q2Q1W2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM71Q2Q1W2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM71Q2Q1W2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM71Q2Q1W2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM71Q2Q1W2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM71Q2Q1W2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM71Q2Q1W2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM71Q2Q1W2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM71Q2Q1W2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM71Q2Q1W2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM71Q2Q1W2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM71Q2Q1W2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM71Q2Q1W2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM71Q2Q1W2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM71Q2Q1W2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM71Q2Q1W2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM71Q2Q1W2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM71Q2Q1W2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM71Q2Q1W2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM71Q2Q1W2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM71Q2Q1W2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM71Q2Q1W2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM71Q2Q1W2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM71Q2Q1W2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM71Q2Q1W2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM71Q2Q1W2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM71Q2Q1W2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM71Q2Q1W2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM71Q2Q1W2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM71Q2Q1W2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM71Q2Q1W2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM71Q2Q1W2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM71Q2Q1W2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM71Q2Q1W2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM71Q2Q1W2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM71Q2Q1W2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM71Q2Q1W2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM71Q2Q1W2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM71Q2Q1W2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM71Q2Q1W2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM71Q2Q1W2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM71Q2Q1W2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM71Q2Q1W2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM71Q2Q1W2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM71Q2Q1W2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM71Q2Q1W2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM71Q2Q1W2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM71Q2Q1W2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM71Q2Q1W2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM71Q2Q1W2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM71Q2Q1W2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM71Q2Q1W2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM71Q2Q1W2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM71Q2Q1W2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM71Q2Q1W2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms