Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PFKFB3Q16875 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PFKFB3Q16875 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PFKFB3Q16875 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PFKFB3Q16875 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PFKFB3Q16875 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PFKFB3Q16875 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PFKFB3Q16875 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PFKFB3Q16875 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PFKFB3Q16875 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PFKFB3Q16875 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PFKFB3Q16875 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PFKFB3Q16875 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PFKFB3Q16875 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PFKFB3Q16875 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PFKFB3Q16875 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PFKFB3Q16875 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PFKFB3Q16875 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PFKFB3Q16875 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PFKFB3Q16875 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PFKFB3Q16875 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PFKFB3Q16875 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PFKFB3Q16875 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PFKFB3Q16875 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PFKFB3Q16875 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PFKFB3Q16875 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PFKFB3Q16875 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PFKFB3Q16875 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PFKFB3Q16875 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PFKFB3Q16875 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PFKFB3Q16875 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PFKFB3Q16875 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PFKFB3Q16875 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PFKFB3Q16875 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PFKFB3Q16875 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PFKFB3Q16875 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PFKFB3Q16875 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PFKFB3Q16875 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PFKFB3Q16875 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PFKFB3Q16875 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PFKFB3Q16875 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PFKFB3Q16875 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PFKFB3Q16875 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PFKFB3Q16875 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PFKFB3Q16875 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PFKFB3Q16875 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PFKFB3Q16875 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PFKFB3Q16875 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PFKFB3Q16875 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PFKFB3Q16875 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PFKFB3Q16875 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PFKFB3Q16875 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PFKFB3Q16875 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PFKFB3Q16875 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PFKFB3Q16875 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PFKFB3Q16875 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PFKFB3Q16875 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PFKFB3Q16875 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PFKFB3Q16875 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PFKFB3Q16875 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PFKFB3Q16875 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PFKFB3Q16875 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PFKFB3Q16875 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PFKFB3Q16875 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PFKFB3Q16875 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PFKFB3Q16875 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PFKFB3Q16875 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PFKFB3Q16875 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PFKFB3Q16875 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PFKFB3Q16875 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PFKFB3Q16875 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PFKFB3Q16875 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PFKFB3Q16875 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PFKFB3Q16875 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PFKFB3Q16875 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PFKFB3Q16875 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PFKFB3Q16875 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PFKFB3Q16875 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PFKFB3Q16875 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PFKFB3Q16875 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PFKFB3Q16875 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PFKFB3Q16875 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PFKFB3Q16875 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PFKFB3Q16875 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PFKFB3Q16875 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PFKFB3Q16875 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PFKFB3Q16875 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PFKFB3Q16875 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PFKFB3Q16875 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PFKFB3Q16875 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PFKFB3Q16875 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PFKFB3Q16875 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PFKFB3Q16875 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PFKFB3Q16875 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PFKFB3Q16875 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PFKFB3Q16875 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PFKFB3Q16875 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PFKFB3Q16875 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PFKFB3Q16875 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PFKFB3Q16875 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.5 ms