Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPROQ16827 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPROQ16827 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPROQ16827 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPROQ16827 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPROQ16827 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPROQ16827 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPROQ16827 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPROQ16827 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPROQ16827 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPROQ16827 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPROQ16827 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPROQ16827 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPROQ16827 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPROQ16827 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPROQ16827 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPROQ16827 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPROQ16827 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPROQ16827 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPROQ16827 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPROQ16827 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPROQ16827 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPROQ16827 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPROQ16827 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPROQ16827 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPROQ16827 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPROQ16827 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPROQ16827 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPROQ16827 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPROQ16827 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPROQ16827 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPROQ16827 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPROQ16827 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPROQ16827 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPROQ16827 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPROQ16827 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPROQ16827 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPROQ16827 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPROQ16827 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPROQ16827 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPROQ16827 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPROQ16827 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPROQ16827 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPROQ16827 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPROQ16827 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPROQ16827 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPROQ16827 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPROQ16827 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPROQ16827 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPROQ16827 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPROQ16827 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPROQ16827 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPROQ16827 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPROQ16827 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPROQ16827 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPROQ16827 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPROQ16827 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPROQ16827 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPROQ16827 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPROQ16827 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPROQ16827 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPROQ16827 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPROQ16827 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPROQ16827 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPROQ16827 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPROQ16827 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPROQ16827 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPROQ16827 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPROQ16827 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPROQ16827 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPROQ16827 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPROQ16827 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPROQ16827 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPROQ16827 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPROQ16827 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPROQ16827 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPROQ16827 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPROQ16827 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPROQ16827 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPROQ16827 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPROQ16827 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPROQ16827 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPROQ16827 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPROQ16827 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPROQ16827 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPROQ16827 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPROQ16827 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPROQ16827 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPROQ16827 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPROQ16827 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPROQ16827 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPROQ16827 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPROQ16827 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPROQ16827 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPROQ16827 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPROQ16827 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPROQ16827 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPROQ16827 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPROQ16827 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPROQ16827 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms