Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFIL3Q16649 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFIL3Q16649 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFIL3Q16649 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFIL3Q16649 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFIL3Q16649 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFIL3Q16649 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFIL3Q16649 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFIL3Q16649 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFIL3Q16649 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFIL3Q16649 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFIL3Q16649 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFIL3Q16649 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFIL3Q16649 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFIL3Q16649 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFIL3Q16649 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFIL3Q16649 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFIL3Q16649 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NFIL3Q16649 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFIL3Q16649 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFIL3Q16649 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFIL3Q16649 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFIL3Q16649 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFIL3Q16649 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFIL3Q16649 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFIL3Q16649 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFIL3Q16649 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NFIL3Q16649 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFIL3Q16649 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFIL3Q16649 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFIL3Q16649 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFIL3Q16649 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NFIL3Q16649 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFIL3Q16649 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFIL3Q16649 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFIL3Q16649 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFIL3Q16649 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFIL3Q16649 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFIL3Q16649 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFIL3Q16649 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFIL3Q16649 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFIL3Q16649 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NFIL3Q16649 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NFIL3Q16649 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFIL3Q16649 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFIL3Q16649 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFIL3Q16649 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFIL3Q16649 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFIL3Q16649 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFIL3Q16649 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFIL3Q16649 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFIL3Q16649 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFIL3Q16649 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFIL3Q16649 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFIL3Q16649 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NFIL3Q16649 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFIL3Q16649 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFIL3Q16649 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NFIL3Q16649 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NFIL3Q16649 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NFIL3Q16649 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NFIL3Q16649 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NFIL3Q16649 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NFIL3Q16649 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NFIL3Q16649 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NFIL3Q16649 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NFIL3Q16649 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFIL3Q16649 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFIL3Q16649 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFIL3Q16649 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFIL3Q16649 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFIL3Q16649 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFIL3Q16649 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFIL3Q16649 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFIL3Q16649 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFIL3Q16649 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFIL3Q16649 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFIL3Q16649 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFIL3Q16649 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFIL3Q16649 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFIL3Q16649 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFIL3Q16649 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFIL3Q16649 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFIL3Q16649 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFIL3Q16649 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFIL3Q16649 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NFIL3Q16649 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFIL3Q16649 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFIL3Q16649 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms