Protein–RNA interactions for Protein: Q16537

PPP2R5E, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit epsilon isoform, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R5EQ16537 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP2R5EQ16537 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP2R5EQ16537 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP2R5EQ16537 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP2R5EQ16537 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP2R5EQ16537 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP2R5EQ16537 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP2R5EQ16537 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP2R5EQ16537 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP2R5EQ16537 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP2R5EQ16537 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP2R5EQ16537 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP2R5EQ16537 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP2R5EQ16537 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP2R5EQ16537 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP2R5EQ16537 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP2R5EQ16537 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP2R5EQ16537 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP2R5EQ16537 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP2R5EQ16537 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP2R5EQ16537 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP2R5EQ16537 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP2R5EQ16537 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP2R5EQ16537 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP2R5EQ16537 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP2R5EQ16537 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP2R5EQ16537 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PPP2R5EQ16537 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PPP2R5EQ16537 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPP2R5EQ16537 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPP2R5EQ16537 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPP2R5EQ16537 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPP2R5EQ16537 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP2R5EQ16537 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP2R5EQ16537 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP2R5EQ16537 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP2R5EQ16537 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP2R5EQ16537 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP2R5EQ16537 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP2R5EQ16537 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP2R5EQ16537 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP2R5EQ16537 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP2R5EQ16537 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP2R5EQ16537 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP2R5EQ16537 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPP2R5EQ16537 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPP2R5EQ16537 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPP2R5EQ16537 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPP2R5EQ16537 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP2R5EQ16537 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP2R5EQ16537 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP2R5EQ16537 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP2R5EQ16537 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP2R5EQ16537 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP2R5EQ16537 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP2R5EQ16537 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PPP2R5EQ16537 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP2R5EQ16537 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP2R5EQ16537 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP2R5EQ16537 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP2R5EQ16537 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP2R5EQ16537 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP2R5EQ16537 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP2R5EQ16537 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP2R5EQ16537 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP2R5EQ16537 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP2R5EQ16537 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP2R5EQ16537 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP2R5EQ16537 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP2R5EQ16537 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP2R5EQ16537 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP2R5EQ16537 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP2R5EQ16537 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP2R5EQ16537 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP2R5EQ16537 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP2R5EQ16537 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP2R5EQ16537 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP2R5EQ16537 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP2R5EQ16537 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP2R5EQ16537 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP2R5EQ16537 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP2R5EQ16537 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP2R5EQ16537 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP2R5EQ16537 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP2R5EQ16537 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP2R5EQ16537 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP2R5EQ16537 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP2R5EQ16537 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP2R5EQ16537 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP2R5EQ16537 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP2R5EQ16537 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP2R5EQ16537 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP2R5EQ16537 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP2R5EQ16537 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP2R5EQ16537 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP2R5EQ16537 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP2R5EQ16537 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP2R5EQ16537 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP2R5EQ16537 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP2R5EQ16537 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms