Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPE65Q16518 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPE65Q16518 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPE65Q16518 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RPE65Q16518 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPE65Q16518 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPE65Q16518 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPE65Q16518 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPE65Q16518 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPE65Q16518 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPE65Q16518 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPE65Q16518 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPE65Q16518 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPE65Q16518 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPE65Q16518 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPE65Q16518 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPE65Q16518 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPE65Q16518 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPE65Q16518 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPE65Q16518 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPE65Q16518 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPE65Q16518 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPE65Q16518 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPE65Q16518 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms