Protein–RNA interactions for Protein: Q15907

RAB11B, Ras-related protein Rab-11B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11BQ15907 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB11BQ15907 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB11BQ15907 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB11BQ15907 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB11BQ15907 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB11BQ15907 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB11BQ15907 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB11BQ15907 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB11BQ15907 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB11BQ15907 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB11BQ15907 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB11BQ15907 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB11BQ15907 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB11BQ15907 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB11BQ15907 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB11BQ15907 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB11BQ15907 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB11BQ15907 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB11BQ15907 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB11BQ15907 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB11BQ15907 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB11BQ15907 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB11BQ15907 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB11BQ15907 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB11BQ15907 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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RAB11BQ15907 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB11BQ15907 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB11BQ15907 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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RAB11BQ15907 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB11BQ15907 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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RAB11BQ15907 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB11BQ15907 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB11BQ15907 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB11BQ15907 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB11BQ15907 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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RAB11BQ15907 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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RAB11BQ15907 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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RAB11BQ15907 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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