Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
VPS72Q15906 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
VPS72Q15906 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
VPS72Q15906 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
VPS72Q15906 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
VPS72Q15906 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
VPS72Q15906 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
VPS72Q15906 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
VPS72Q15906 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
VPS72Q15906 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
VPS72Q15906 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
VPS72Q15906 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
VPS72Q15906 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
VPS72Q15906 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
VPS72Q15906 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
VPS72Q15906 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
VPS72Q15906 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
VPS72Q15906 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
VPS72Q15906 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
VPS72Q15906 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
VPS72Q15906 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
VPS72Q15906 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
VPS72Q15906 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
VPS72Q15906 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
VPS72Q15906 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
VPS72Q15906 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
VPS72Q15906 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
VPS72Q15906 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
VPS72Q15906 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
VPS72Q15906 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
VPS72Q15906 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
VPS72Q15906 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
VPS72Q15906 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
VPS72Q15906 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
VPS72Q15906 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
VPS72Q15906 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
VPS72Q15906 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
VPS72Q15906 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
VPS72Q15906 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
VPS72Q15906 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
VPS72Q15906 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
VPS72Q15906 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
VPS72Q15906 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
VPS72Q15906 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
VPS72Q15906 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
VPS72Q15906 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
VPS72Q15906 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
VPS72Q15906 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
VPS72Q15906 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
VPS72Q15906 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
VPS72Q15906 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
VPS72Q15906 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
VPS72Q15906 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
VPS72Q15906 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
VPS72Q15906 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
VPS72Q15906 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
VPS72Q15906 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
VPS72Q15906 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
VPS72Q15906 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
VPS72Q15906 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
VPS72Q15906 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
VPS72Q15906 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
VPS72Q15906 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
VPS72Q15906 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
VPS72Q15906 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
VPS72Q15906 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
VPS72Q15906 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
VPS72Q15906 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
VPS72Q15906 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
VPS72Q15906 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
VPS72Q15906 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
VPS72Q15906 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
VPS72Q15906 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
VPS72Q15906 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
VPS72Q15906 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
VPS72Q15906 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
VPS72Q15906 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
VPS72Q15906 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
VPS72Q15906 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
VPS72Q15906 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
VPS72Q15906 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
VPS72Q15906 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
VPS72Q15906 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
VPS72Q15906 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
VPS72Q15906 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
VPS72Q15906 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
VPS72Q15906 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
VPS72Q15906 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
VPS72Q15906 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
VPS72Q15906 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
VPS72Q15906 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
VPS72Q15906 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
VPS72Q15906 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
VPS72Q15906 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
VPS72Q15906 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
VPS72Q15906 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
VPS72Q15906 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
VPS72Q15906 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
VPS72Q15906 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
VPS72Q15906 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms