Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF13Q15543 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TAF13Q15543 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TAF13Q15543 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF13Q15543 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF13Q15543 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF13Q15543 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF13Q15543 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF13Q15543 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF13Q15543 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TAF13Q15543 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TAF13Q15543 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TAF13Q15543 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TAF13Q15543 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TAF13Q15543 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF13Q15543 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF13Q15543 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF13Q15543 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF13Q15543 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF13Q15543 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TAF13Q15543 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF13Q15543 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF13Q15543 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF13Q15543 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF13Q15543 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF13Q15543 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF13Q15543 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF13Q15543 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF13Q15543 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF13Q15543 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF13Q15543 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms