Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKIV2LQ15477 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKIV2LQ15477 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKIV2LQ15477 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKIV2LQ15477 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKIV2LQ15477 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKIV2LQ15477 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKIV2LQ15477 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKIV2LQ15477 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SKIV2LQ15477 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKIV2LQ15477 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKIV2LQ15477 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKIV2LQ15477 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKIV2LQ15477 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKIV2LQ15477 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKIV2LQ15477 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKIV2LQ15477 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKIV2LQ15477 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKIV2LQ15477 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKIV2LQ15477 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKIV2LQ15477 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKIV2LQ15477 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SKIV2LQ15477 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKIV2LQ15477 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKIV2LQ15477 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKIV2LQ15477 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKIV2LQ15477 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKIV2LQ15477 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKIV2LQ15477 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKIV2LQ15477 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKIV2LQ15477 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKIV2LQ15477 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKIV2LQ15477 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKIV2LQ15477 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKIV2LQ15477 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SKIV2LQ15477 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKIV2LQ15477 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKIV2LQ15477 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SKIV2LQ15477 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SKIV2LQ15477 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SKIV2LQ15477 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SKIV2LQ15477 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKIV2LQ15477 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKIV2LQ15477 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKIV2LQ15477 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKIV2LQ15477 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKIV2LQ15477 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKIV2LQ15477 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKIV2LQ15477 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKIV2LQ15477 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKIV2LQ15477 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKIV2LQ15477 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKIV2LQ15477 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKIV2LQ15477 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKIV2LQ15477 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKIV2LQ15477 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SKIV2LQ15477 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKIV2LQ15477 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKIV2LQ15477 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKIV2LQ15477 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKIV2LQ15477 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKIV2LQ15477 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKIV2LQ15477 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SKIV2LQ15477 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SKIV2LQ15477 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SKIV2LQ15477 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SKIV2LQ15477 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SKIV2LQ15477 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SKIV2LQ15477 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SKIV2LQ15477 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SKIV2LQ15477 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKIV2LQ15477 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKIV2LQ15477 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SKIV2LQ15477 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKIV2LQ15477 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKIV2LQ15477 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SKIV2LQ15477 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SKIV2LQ15477 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SKIV2LQ15477 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SKIV2LQ15477 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SKIV2LQ15477 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKIV2LQ15477 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKIV2LQ15477 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKIV2LQ15477 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKIV2LQ15477 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKIV2LQ15477 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKIV2LQ15477 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKIV2LQ15477 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKIV2LQ15477 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKIV2LQ15477 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKIV2LQ15477 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKIV2LQ15477 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKIV2LQ15477 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKIV2LQ15477 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKIV2LQ15477 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SKIV2LQ15477 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SKIV2LQ15477 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SKIV2LQ15477 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SKIV2LQ15477 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SKIV2LQ15477 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms