Protein–RNA interactions for Protein: Q15293

RCN1, Reticulocalbin-1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN1Q15293 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCN1Q15293 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCN1Q15293 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCN1Q15293 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCN1Q15293 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCN1Q15293 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCN1Q15293 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCN1Q15293 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCN1Q15293 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCN1Q15293 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCN1Q15293 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCN1Q15293 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCN1Q15293 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCN1Q15293 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCN1Q15293 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCN1Q15293 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCN1Q15293 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCN1Q15293 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCN1Q15293 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCN1Q15293 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCN1Q15293 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCN1Q15293 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCN1Q15293 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCN1Q15293 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCN1Q15293 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RCN1Q15293 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCN1Q15293 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCN1Q15293 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCN1Q15293 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCN1Q15293 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCN1Q15293 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCN1Q15293 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCN1Q15293 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCN1Q15293 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCN1Q15293 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCN1Q15293 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCN1Q15293 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCN1Q15293 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCN1Q15293 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
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RCN1Q15293 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCN1Q15293 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
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RCN1Q15293 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCN1Q15293 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
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RCN1Q15293 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
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RCN1Q15293 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
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RCN1Q15293 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCN1Q15293 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCN1Q15293 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
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RCN1Q15293 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCN1Q15293 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
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RCN1Q15293 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCN1Q15293 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCN1Q15293 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCN1Q15293 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
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RCN1Q15293 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCN1Q15293 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RCN1Q15293 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
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RCN1Q15293 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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RCN1Q15293 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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RCN1Q15293 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCN1Q15293 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCN1Q15293 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
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RCN1Q15293 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCN1Q15293 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCN1Q15293 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCN1Q15293 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCN1Q15293 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCN1Q15293 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCN1Q15293 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RCN1Q15293 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCN1Q15293 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCN1Q15293 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCN1Q15293 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCN1Q15293 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCN1Q15293 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCN1Q15293 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCN1Q15293 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RCN1Q15293 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCN1Q15293 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCN1Q15293 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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