Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRRQ15256 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRRQ15256 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRRQ15256 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRRQ15256 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRRQ15256 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRRQ15256 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRRQ15256 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRRQ15256 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRRQ15256 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRRQ15256 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRRQ15256 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRRQ15256 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRRQ15256 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRRQ15256 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRRQ15256 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRRQ15256 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRRQ15256 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRRQ15256 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRRQ15256 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms