Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARHGEF6Q15052 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARHGEF6Q15052 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARHGEF6Q15052 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARHGEF6Q15052 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARHGEF6Q15052 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARHGEF6Q15052 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARHGEF6Q15052 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARHGEF6Q15052 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ARHGEF6Q15052 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARHGEF6Q15052 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ARHGEF6Q15052 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARHGEF6Q15052 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARHGEF6Q15052 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARHGEF6Q15052 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARHGEF6Q15052 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARHGEF6Q15052 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARHGEF6Q15052 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARHGEF6Q15052 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARHGEF6Q15052 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARHGEF6Q15052 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARHGEF6Q15052 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARHGEF6Q15052 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ARHGEF6Q15052 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
ARHGEF6Q15052 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ARHGEF6Q15052 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARHGEF6Q15052 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARHGEF6Q15052 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARHGEF6Q15052 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARHGEF6Q15052 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARHGEF6Q15052 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARHGEF6Q15052 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARHGEF6Q15052 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARHGEF6Q15052 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARHGEF6Q15052 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ARHGEF6Q15052 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARHGEF6Q15052 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARHGEF6Q15052 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARHGEF6Q15052 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARHGEF6Q15052 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARHGEF6Q15052 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARHGEF6Q15052 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ARHGEF6Q15052 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF6Q15052 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF6Q15052 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF6Q15052 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF6Q15052 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARHGEF6Q15052 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARHGEF6Q15052 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARHGEF6Q15052 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARHGEF6Q15052 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARHGEF6Q15052 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARHGEF6Q15052 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARHGEF6Q15052 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARHGEF6Q15052 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARHGEF6Q15052 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARHGEF6Q15052 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARHGEF6Q15052 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARHGEF6Q15052 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARHGEF6Q15052 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARHGEF6Q15052 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARHGEF6Q15052 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARHGEF6Q15052 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARHGEF6Q15052 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARHGEF6Q15052 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARHGEF6Q15052 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARHGEF6Q15052 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARHGEF6Q15052 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARHGEF6Q15052 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARHGEF6Q15052 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARHGEF6Q15052 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARHGEF6Q15052 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARHGEF6Q15052 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARHGEF6Q15052 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARHGEF6Q15052 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARHGEF6Q15052 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARHGEF6Q15052 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ARHGEF6Q15052 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARHGEF6Q15052 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARHGEF6Q15052 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ARHGEF6Q15052 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARHGEF6Q15052 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARHGEF6Q15052 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARHGEF6Q15052 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARHGEF6Q15052 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARHGEF6Q15052 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARHGEF6Q15052 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ARHGEF6Q15052 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARHGEF6Q15052 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARHGEF6Q15052 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARHGEF6Q15052 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ARHGEF6Q15052 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARHGEF6Q15052 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARHGEF6Q15052 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARHGEF6Q15052 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARHGEF6Q15052 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARHGEF6Q15052 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARHGEF6Q15052 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARHGEF6Q15052 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARHGEF6Q15052 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms