Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAM2Q15035 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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