Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERPUD1Q15011 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERPUD1Q15011 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERPUD1Q15011 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERPUD1Q15011 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERPUD1Q15011 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HERPUD1Q15011 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERPUD1Q15011 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERPUD1Q15011 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERPUD1Q15011 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERPUD1Q15011 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERPUD1Q15011 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERPUD1Q15011 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERPUD1Q15011 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERPUD1Q15011 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERPUD1Q15011 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERPUD1Q15011 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
HERPUD1Q15011 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERPUD1Q15011 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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