Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIDRQ14159 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIDRQ14159 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIDRQ14159 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIDRQ14159 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIDRQ14159 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIDRQ14159 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIDRQ14159 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIDRQ14159 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIDRQ14159 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIDRQ14159 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIDRQ14159 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIDRQ14159 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPIDRQ14159 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPIDRQ14159 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPIDRQ14159 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIDRQ14159 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIDRQ14159 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIDRQ14159 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIDRQ14159 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIDRQ14159 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIDRQ14159 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIDRQ14159 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIDRQ14159 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIDRQ14159 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIDRQ14159 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIDRQ14159 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIDRQ14159 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIDRQ14159 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIDRQ14159 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIDRQ14159 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIDRQ14159 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIDRQ14159 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIDRQ14159 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIDRQ14159 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIDRQ14159 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIDRQ14159 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIDRQ14159 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIDRQ14159 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIDRQ14159 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIDRQ14159 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
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