Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL4A6Q14031 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL4A6Q14031 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL4A6Q14031 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL4A6Q14031 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL4A6Q14031 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL4A6Q14031 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL4A6Q14031 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL4A6Q14031 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
COL4A6Q14031 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL4A6Q14031 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL4A6Q14031 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL4A6Q14031 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
COL4A6Q14031 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL4A6Q14031 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL4A6Q14031 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL4A6Q14031 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
COL4A6Q14031 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL4A6Q14031 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL4A6Q14031 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL4A6Q14031 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
COL4A6Q14031 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL4A6Q14031 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL4A6Q14031 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL4A6Q14031 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL4A6Q14031 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL4A6Q14031 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL4A6Q14031 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL4A6Q14031 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL4A6Q14031 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL4A6Q14031 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL4A6Q14031 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL4A6Q14031 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL4A6Q14031 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL4A6Q14031 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL4A6Q14031 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
COL4A6Q14031 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL4A6Q14031 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL4A6Q14031 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL4A6Q14031 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL4A6Q14031 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL4A6Q14031 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
COL4A6Q14031 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
COL4A6Q14031 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
COL4A6Q14031 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
COL4A6Q14031 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL4A6Q14031 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
COL4A6Q14031 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL4A6Q14031 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL4A6Q14031 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL4A6Q14031 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL4A6Q14031 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
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