Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBFBQ13951 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBFBQ13951 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBFBQ13951 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBFBQ13951 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBFBQ13951 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBFBQ13951 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBFBQ13951 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBFBQ13951 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBFBQ13951 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBFBQ13951 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBFBQ13951 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBFBQ13951 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBFBQ13951 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBFBQ13951 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBFBQ13951 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBFBQ13951 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBFBQ13951 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBFBQ13951 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBFBQ13951 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBFBQ13951 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CBFBQ13951 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBFBQ13951 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CBFBQ13951 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBFBQ13951 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBFBQ13951 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBFBQ13951 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBFBQ13951 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBFBQ13951 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBFBQ13951 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CBFBQ13951 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBFBQ13951 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBFBQ13951 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBFBQ13951 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBFBQ13951 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBFBQ13951 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBFBQ13951 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBFBQ13951 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBFBQ13951 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBFBQ13951 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBFBQ13951 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBFBQ13951 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBFBQ13951 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBFBQ13951 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBFBQ13951 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBFBQ13951 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBFBQ13951 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CBFBQ13951 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBFBQ13951 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBFBQ13951 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBFBQ13951 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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