Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2H3Q13889 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2H3Q13889 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2H3Q13889 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2H3Q13889 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2H3Q13889 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2H3Q13889 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2H3Q13889 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2H3Q13889 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2H3Q13889 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2H3Q13889 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2H3Q13889 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2H3Q13889 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2H3Q13889 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2H3Q13889 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2H3Q13889 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2H3Q13889 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2H3Q13889 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2H3Q13889 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2H3Q13889 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2H3Q13889 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2H3Q13889 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2H3Q13889 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2H3Q13889 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2H3Q13889 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2H3Q13889 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2H3Q13889 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2H3Q13889 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2H3Q13889 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2H3Q13889 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2H3Q13889 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2H3Q13889 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2H3Q13889 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2H3Q13889 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2H3Q13889 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2H3Q13889 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2H3Q13889 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2H3Q13889 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2H3Q13889 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2H3Q13889 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2H3Q13889 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2H3Q13889 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2H3Q13889 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2H3Q13889 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
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