Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNFAIP1Q13829 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNFAIP1Q13829 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNFAIP1Q13829 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNFAIP1Q13829 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNFAIP1Q13829 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNFAIP1Q13829 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNFAIP1Q13829 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNFAIP1Q13829 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNFAIP1Q13829 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNFAIP1Q13829 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNFAIP1Q13829 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TNFAIP1Q13829 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNFAIP1Q13829 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNFAIP1Q13829 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNFAIP1Q13829 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNFAIP1Q13829 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNFAIP1Q13829 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNFAIP1Q13829 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNFAIP1Q13829 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNFAIP1Q13829 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNFAIP1Q13829 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNFAIP1Q13829 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNFAIP1Q13829 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNFAIP1Q13829 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNFAIP1Q13829 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNFAIP1Q13829 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNFAIP1Q13829 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNFAIP1Q13829 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNFAIP1Q13829 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNFAIP1Q13829 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNFAIP1Q13829 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNFAIP1Q13829 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNFAIP1Q13829 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TNFAIP1Q13829 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNFAIP1Q13829 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TNFAIP1Q13829 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNFAIP1Q13829 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNFAIP1Q13829 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNFAIP1Q13829 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TNFAIP1Q13829 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNFAIP1Q13829 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNFAIP1Q13829 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNFAIP1Q13829 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNFAIP1Q13829 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TNFAIP1Q13829 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNFAIP1Q13829 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNFAIP1Q13829 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TNFAIP1Q13829 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNFAIP1Q13829 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNFAIP1Q13829 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNFAIP1Q13829 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNFAIP1Q13829 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNFAIP1Q13829 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNFAIP1Q13829 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNFAIP1Q13829 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
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