Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX6Q13608 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEX6Q13608 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX6Q13608 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX6Q13608 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PEX6Q13608 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PEX6Q13608 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PEX6Q13608 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PEX6Q13608 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PEX6Q13608 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PEX6Q13608 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PEX6Q13608 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PEX6Q13608 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PEX6Q13608 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PEX6Q13608 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PEX6Q13608 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX6Q13608 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX6Q13608 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX6Q13608 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX6Q13608 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX6Q13608 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX6Q13608 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX6Q13608 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX6Q13608 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX6Q13608 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX6Q13608 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PEX6Q13608 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PEX6Q13608 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PEX6Q13608 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PEX6Q13608 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PEX6Q13608 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PEX6Q13608 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PEX6Q13608 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PEX6Q13608 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PEX6Q13608 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PEX6Q13608 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PEX6Q13608 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PEX6Q13608 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PEX6Q13608 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PEX6Q13608 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
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