Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX1Q13596 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX1Q13596 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX1Q13596 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX1Q13596 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX1Q13596 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX1Q13596 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX1Q13596 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX1Q13596 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX1Q13596 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX1Q13596 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX1Q13596 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX1Q13596 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX1Q13596 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX1Q13596 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX1Q13596 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX1Q13596 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX1Q13596 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX1Q13596 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX1Q13596 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX1Q13596 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX1Q13596 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX1Q13596 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX1Q13596 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX1Q13596 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX1Q13596 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX1Q13596 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX1Q13596 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX1Q13596 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX1Q13596 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX1Q13596 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX1Q13596 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX1Q13596 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX1Q13596 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX1Q13596 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX1Q13596 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX1Q13596 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX1Q13596 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX1Q13596 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNX1Q13596 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX1Q13596 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX1Q13596 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX1Q13596 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX1Q13596 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX1Q13596 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX1Q13596 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX1Q13596 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX1Q13596 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX1Q13596 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX1Q13596 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
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