Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NEUROD1Q13562 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
NEUROD1Q13562 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
NEUROD1Q13562 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NEUROD1Q13562 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NEUROD1Q13562 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NEUROD1Q13562 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NEUROD1Q13562 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NEUROD1Q13562 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NEUROD1Q13562 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NEUROD1Q13562 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NEUROD1Q13562 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NEUROD1Q13562 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NEUROD1Q13562 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NEUROD1Q13562 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NEUROD1Q13562 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NEUROD1Q13562 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NEUROD1Q13562 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NEUROD1Q13562 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
NEUROD1Q13562 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NEUROD1Q13562 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NEUROD1Q13562 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NEUROD1Q13562 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NEUROD1Q13562 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NEUROD1Q13562 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
NEUROD1Q13562 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
NEUROD1Q13562 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
NEUROD1Q13562 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
NEUROD1Q13562 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NEUROD1Q13562 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
NEUROD1Q13562 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NEUROD1Q13562 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NEUROD1Q13562 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NEUROD1Q13562 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NEUROD1Q13562 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
NEUROD1Q13562 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NEUROD1Q13562 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NEUROD1Q13562 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NEUROD1Q13562 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NEUROD1Q13562 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NEUROD1Q13562 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NEUROD1Q13562 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NEUROD1Q13562 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NEUROD1Q13562 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NEUROD1Q13562 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
NEUROD1Q13562 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NEUROD1Q13562 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
NEUROD1Q13562 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NEUROD1Q13562 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NEUROD1Q13562 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
NEUROD1Q13562 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NEUROD1Q13562 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
NEUROD1Q13562 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
NEUROD1Q13562 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
NEUROD1Q13562 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
NEUROD1Q13562 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
NEUROD1Q13562 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NEUROD1Q13562 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
NEUROD1Q13562 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
NEUROD1Q13562 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NEUROD1Q13562 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
NEUROD1Q13562 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NEUROD1Q13562 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NEUROD1Q13562 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NEUROD1Q13562 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
NEUROD1Q13562 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
NEUROD1Q13562 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NEUROD1Q13562 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NEUROD1Q13562 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NEUROD1Q13562 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NEUROD1Q13562 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NEUROD1Q13562 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NEUROD1Q13562 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NEUROD1Q13562 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NEUROD1Q13562 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NEUROD1Q13562 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NEUROD1Q13562 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NEUROD1Q13562 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NEUROD1Q13562 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NEUROD1Q13562 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NEUROD1Q13562 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NEUROD1Q13562 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NEUROD1Q13562 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NEUROD1Q13562 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
NEUROD1Q13562 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
NEUROD1Q13562 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
NEUROD1Q13562 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
NEUROD1Q13562 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NEUROD1Q13562 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NEUROD1Q13562 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NEUROD1Q13562 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
NEUROD1Q13562 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
NEUROD1Q13562 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
NEUROD1Q13562 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
NEUROD1Q13562 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NEUROD1Q13562 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NEUROD1Q13562 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NEUROD1Q13562 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NEUROD1Q13562 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NEUROD1Q13562 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
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