Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRPF4BQ13523 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRPF4BQ13523 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRPF4BQ13523 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF4BQ13523 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF4BQ13523 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF4BQ13523 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF4BQ13523 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF4BQ13523 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF4BQ13523 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF4BQ13523 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF4BQ13523 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF4BQ13523 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF4BQ13523 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF4BQ13523 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF4BQ13523 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF4BQ13523 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRPF4BQ13523 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRPF4BQ13523 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRPF4BQ13523 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRPF4BQ13523 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRPF4BQ13523 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRPF4BQ13523 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRPF4BQ13523 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRPF4BQ13523 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRPF4BQ13523 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PRPF4BQ13523 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
PRPF4BQ13523 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRPF4BQ13523 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRPF4BQ13523 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PRPF4BQ13523 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRPF4BQ13523 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRPF4BQ13523 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRPF4BQ13523 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRPF4BQ13523 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRPF4BQ13523 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRPF4BQ13523 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRPF4BQ13523 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRPF4BQ13523 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PRPF4BQ13523 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRPF4BQ13523 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRPF4BQ13523 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRPF4BQ13523 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRPF4BQ13523 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRPF4BQ13523 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRPF4BQ13523 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRPF4BQ13523 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRPF4BQ13523 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRPF4BQ13523 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRPF4BQ13523 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRPF4BQ13523 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRPF4BQ13523 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRPF4BQ13523 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRPF4BQ13523 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRPF4BQ13523 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRPF4BQ13523 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRPF4BQ13523 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPF4BQ13523 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPF4BQ13523 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPF4BQ13523 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPF4BQ13523 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPF4BQ13523 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPF4BQ13523 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
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