Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MSLNQ13421 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MSLNQ13421 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MSLNQ13421 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MSLNQ13421 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSLNQ13421 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSLNQ13421 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSLNQ13421 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSLNQ13421 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSLNQ13421 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSLNQ13421 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSLNQ13421 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSLNQ13421 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSLNQ13421 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSLNQ13421 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSLNQ13421 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSLNQ13421 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSLNQ13421 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSLNQ13421 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSLNQ13421 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSLNQ13421 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSLNQ13421 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSLNQ13421 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSLNQ13421 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSLNQ13421 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSLNQ13421 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSLNQ13421 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MSLNQ13421 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSLNQ13421 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSLNQ13421 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSLNQ13421 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSLNQ13421 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSLNQ13421 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSLNQ13421 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSLNQ13421 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSLNQ13421 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSLNQ13421 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MSLNQ13421 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSLNQ13421 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSLNQ13421 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MSLNQ13421 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSLNQ13421 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSLNQ13421 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms