Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

Predictions only

Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATMQ13315 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATMQ13315 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATMQ13315 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATMQ13315 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATMQ13315 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATMQ13315 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATMQ13315 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATMQ13315 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATMQ13315 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATMQ13315 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATMQ13315 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATMQ13315 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATMQ13315 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATMQ13315 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATMQ13315 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATMQ13315 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATMQ13315 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATMQ13315 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATMQ13315 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATMQ13315 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATMQ13315 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATMQ13315 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATMQ13315 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATMQ13315 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATMQ13315 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATMQ13315 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATMQ13315 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATMQ13315 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATMQ13315 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATMQ13315 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATMQ13315 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATMQ13315 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATMQ13315 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATMQ13315 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATMQ13315 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATMQ13315 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATMQ13315 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATMQ13315 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATMQ13315 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATMQ13315 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATMQ13315 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATMQ13315 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATMQ13315 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATMQ13315 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATMQ13315 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATMQ13315 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATMQ13315 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATMQ13315 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATMQ13315 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATMQ13315 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATMQ13315 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ATMQ13315 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATMQ13315 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATMQ13315 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATMQ13315 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATMQ13315 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATMQ13315 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATMQ13315 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATMQ13315 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATMQ13315 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATMQ13315 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATMQ13315 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATMQ13315 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATMQ13315 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATMQ13315 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATMQ13315 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATMQ13315 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATMQ13315 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATMQ13315 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATMQ13315 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATMQ13315 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATMQ13315 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATMQ13315 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATMQ13315 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATMQ13315 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATMQ13315 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATMQ13315 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATMQ13315 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATMQ13315 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATMQ13315 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATMQ13315 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATMQ13315 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATMQ13315 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATMQ13315 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATMQ13315 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATMQ13315 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATMQ13315 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATMQ13315 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATMQ13315 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATMQ13315 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATMQ13315 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATMQ13315 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATMQ13315 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATMQ13315 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATMQ13315 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATMQ13315 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATMQ13315 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATMQ13315 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATMQ13315 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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