Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 NQO1-203ENST00000379047 2527 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.881e-9■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 NQO1-204ENST00000439109 924 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.931e-9■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 NQO1-205ENST00000561500 891 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.021e-9■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.061e-9■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.371e-9■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 HSD17B4-209ENST00000507695 324 ntTSL 55.05□□□□□ -1.62e-6■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 PSMD2-209ENST00000460628 565 ntTSL 211.53□□□□□ -0.566e-7■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 PTMS-205ENST00000540828 644 ntTSL 1 (best)26.15■■□□□ 1.784e-7■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.624e-7■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.374e-7■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.854e-7■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 PTMS-204ENST00000540667 820 ntTSL 216.56■□□□□ 0.244e-7■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.494e-7■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 AKR1C3-206ENST00000602997 636 ntTSL 35.98□□□□□ -1.458e-7■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 AKR1C3-210ENST00000605322 846 ntTSL 1 (best)5.6□□□□□ -1.518e-7■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.384e-7■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.994e-7■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.994e-7■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.994e-7■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 MACF1-207ENST00000442046 2299 ntTSL 516.69■□□□□ 0.264e-7■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.847e-7■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 NSFL1C-204ENST00000461211 3799 ntTSL 58.44□□□□□ -1.066e-7■■■■□ 21.2
G3BP1Q13283 TNS3-204ENST00000428457 5070 ntTSL 1 (best)11.98□□□□□ -0.492e-7■■■■□ 21.2
G3BP1Q13283 BAG6-262ENST00000470875 1000 ntTSL 526.98■■□□□ 1.914e-8■■■■□ 21.2
G3BP1Q13283 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.763e-7■■■■□ 21.2
G3BP1Q13283 COX5B-202ENST00000464949 613 ntTSL 525.18■■□□□ 1.623e-7■■■■□ 21.2
G3BP1Q13283 COX5B-203ENST00000491989 611 ntTSL 311.24□□□□□ -0.613e-7■■■■□ 21.2
G3BP1Q13283 UMPS-210ENST00000498715 832 ntTSL 312.13□□□□□ -0.474e-7■■■■□ 21.2
G3BP1Q13283 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.797e-13■■■■□ 21.2
G3BP1Q13283 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.797e-13■■■■□ 21.2
G3BP1Q13283 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.567e-13■■■■□ 21.2
G3BP1Q13283 PAICS-205ENST00000508554 698 ntTSL 210.18□□□□□ -0.785e-8■■■■□ 21.2
G3BP1Q13283 TCOF1-213ENST00000514442 5195 ntTSL 215.94■□□□□ 0.142e-7■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 AEN-204ENST00000558327 883 ntTSL 231.77■■■□□ 2.684e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 MSH2-203ENST00000454849 560 ntTSL 430.83■■■□□ 2.534e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 AEN-205ENST00000559528 895 ntTSL 229.82■■■□□ 2.364e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 AEN-206ENST00000560174 461 ntTSL 329.14■■■□□ 2.264e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.944e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.644e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 WDR74-203ENST00000453708 617 ntTSL 224.76■■□□□ 1.554e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.554e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 PSMC3-203ENST00000526993 580 ntTSL 224.15■■□□□ 1.464e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.454e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 WDR74-217ENST00000545112 788 ntTSL 224.13■■□□□ 1.454e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 TMEM50A-206ENST00000498135 776 ntTSL 323.71■■□□□ 1.394e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.384e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 WDR74-210ENST00000538277 565 ntTSL 423.69■■□□□ 1.384e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 TMEM50A-203ENST00000480937 1102 ntTSL 223.2■■□□□ 1.34e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 WDR74-212ENST00000541930 827 ntTSL 522.38■■□□□ 1.174e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 WDR74-213ENST00000542347 988 ntTSL 221.65■■□□□ 1.064e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 TMEM50A-202ENST00000468704 799 ntTSL 321.26■□□□□ 0.994e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.984e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.984e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 ATAD3A-201ENST00000339113 2330 ntTSL 221■□□□□ 0.954e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 WDR74-211ENST00000540620 984 ntTSL 320.89■□□□□ 0.934e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 AEN-202ENST00000557787 1242 ntTSL 1 (best)20.49■□□□□ 0.874e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.864e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.784e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.764e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 LIG1-206ENST00000594067 2697 ntTSL 219.73■□□□□ 0.754e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 AHSA1-213ENST00000557476 584 ntTSL 319.63■□□□□ 0.736e-8■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.724e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 TSR1-202ENST00000571806 794 ntTSL 219.17■□□□□ 0.664e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.634e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.594e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.574e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 TMEM50A-205ENST00000491936 965 ntTSL 1 (best)18.55■□□□□ 0.564e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.524e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.484e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.424e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.394e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 USP5-206ENST00000542087 438 ntTSL 317.5■□□□□ 0.392e-7■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.334e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 ATP7B-207ENST00000466629 463 ntTSL 217.01■□□□□ 0.314e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.284e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 ATP7B-214ENST00000634810 5825 ntTSL 1 (best)16.66■□□□□ 0.264e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 ATP7B-210ENST00000634296 2328 ntTSL 516.64■□□□□ 0.254e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.244e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 TSR1-205ENST00000576202 573 ntTSL 216.05■□□□□ 0.164e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.094e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 LIG1-201ENST00000263274 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.024e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 LIG1-221ENST00000613670 3949 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 04e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 FAH-211ENST00000561353 324 ntTSL 515.06■□□□□ 04e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 TUBA1A-207ENST00000550767 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.044e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 AHSA1-210ENST00000556369 849 ntTSL 514.72□□□□□ -0.051e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 LIG1-207ENST00000594759 4102 ntTSL 1 (best)14.09□□□□□ -0.154e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 HIF1AN-205ENST00000533589 1042 ntTSL 313.87□□□□□ -0.194e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 LIG1-210ENST00000596332 584 ntTSL 213.11□□□□□ -0.314e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 ATP7B-213ENST00000634620 5653 ntTSL 1 (best)13.03□□□□□ -0.324e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 NUMB-202ENST00000356296 3453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.334e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 LIG1-213ENST00000596672 792 ntTSL 312.96□□□□□ -0.334e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 GOLGA2-211ENST00000496221 450 ntTSL 312.7□□□□□ -0.384e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 NUMB-212ENST00000554546 3607 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.384e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 FAH-209ENST00000559217 619 ntTSL 212.62□□□□□ -0.394e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 LIG1-220ENST00000601091 3957 ntTSL 512.43□□□□□ -0.424e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 TCF20-201ENST00000335626 6237 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.434e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 WDR74-209ENST00000538150 487 ntTSL 312.2□□□□□ -0.464e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 TCF20-202ENST00000359486 7410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.624e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 SBNO1-203ENST00000602398 4313 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.624e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 TCP1-218ENST00000546204 566 ntTSL 210.85□□□□□ -0.674e-6■■■■□ 21.1
Retrieved 100 of 11,245 protein–RNA pairs in 600.9 ms