Protein–RNA interactions for Protein: Q13219

PAPPA, Pappalysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPAQ13219 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PAPPAQ13219 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PAPPAQ13219 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PAPPAQ13219 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PAPPAQ13219 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PAPPAQ13219 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PAPPAQ13219 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PAPPAQ13219 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PAPPAQ13219 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PAPPAQ13219 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
PAPPAQ13219 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PAPPAQ13219 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PAPPAQ13219 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PAPPAQ13219 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PAPPAQ13219 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PAPPAQ13219 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PAPPAQ13219 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PAPPAQ13219 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PAPPAQ13219 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PAPPAQ13219 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PAPPAQ13219 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PAPPAQ13219 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PAPPAQ13219 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PAPPAQ13219 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PAPPAQ13219 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PAPPAQ13219 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PAPPAQ13219 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PAPPAQ13219 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PAPPAQ13219 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PAPPAQ13219 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PAPPAQ13219 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PAPPAQ13219 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PAPPAQ13219 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PAPPAQ13219 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PAPPAQ13219 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PAPPAQ13219 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PAPPAQ13219 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PAPPAQ13219 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PAPPAQ13219 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PAPPAQ13219 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PAPPAQ13219 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PAPPAQ13219 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PAPPAQ13219 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PAPPAQ13219 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
PAPPAQ13219 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PAPPAQ13219 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PAPPAQ13219 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PAPPAQ13219 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PAPPAQ13219 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
PAPPAQ13219 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PAPPAQ13219 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PAPPAQ13219 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PAPPAQ13219 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PAPPAQ13219 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PAPPAQ13219 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PAPPAQ13219 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PAPPAQ13219 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
PAPPAQ13219 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
PAPPAQ13219 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
PAPPAQ13219 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PAPPAQ13219 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
PAPPAQ13219 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PAPPAQ13219 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PAPPAQ13219 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PAPPAQ13219 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
PAPPAQ13219 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
PAPPAQ13219 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PAPPAQ13219 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PAPPAQ13219 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PAPPAQ13219 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PAPPAQ13219 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PAPPAQ13219 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PAPPAQ13219 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PAPPAQ13219 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PAPPAQ13219 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
PAPPAQ13219 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PAPPAQ13219 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PAPPAQ13219 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PAPPAQ13219 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PAPPAQ13219 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
PAPPAQ13219 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
PAPPAQ13219 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
PAPPAQ13219 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
PAPPAQ13219 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PAPPAQ13219 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PAPPAQ13219 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PAPPAQ13219 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PAPPAQ13219 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PAPPAQ13219 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PAPPAQ13219 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PAPPAQ13219 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PAPPAQ13219 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PAPPAQ13219 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
PAPPAQ13219 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PAPPAQ13219 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PAPPAQ13219 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
PAPPAQ13219 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PAPPAQ13219 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PAPPAQ13219 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PAPPAQ13219 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms