Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPS1Q13098 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPS1Q13098 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPS1Q13098 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPS1Q13098 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPS1Q13098 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPS1Q13098 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPS1Q13098 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPS1Q13098 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPS1Q13098 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPS1Q13098 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPS1Q13098 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPS1Q13098 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPS1Q13098 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPS1Q13098 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPS1Q13098 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GPS1Q13098 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPS1Q13098 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPS1Q13098 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GPS1Q13098 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPS1Q13098 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPS1Q13098 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPS1Q13098 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPS1Q13098 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPS1Q13098 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPS1Q13098 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPS1Q13098 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPS1Q13098 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPS1Q13098 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPS1Q13098 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPS1Q13098 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPS1Q13098 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GPS1Q13098 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GPS1Q13098 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPS1Q13098 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPS1Q13098 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPS1Q13098 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPS1Q13098 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPS1Q13098 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPS1Q13098 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPS1Q13098 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPS1Q13098 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPS1Q13098 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPS1Q13098 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPS1Q13098 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPS1Q13098 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPS1Q13098 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPS1Q13098 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GPS1Q13098 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPS1Q13098 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPS1Q13098 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPS1Q13098 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GPS1Q13098 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GPS1Q13098 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPS1Q13098 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPS1Q13098 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPS1Q13098 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPS1Q13098 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPS1Q13098 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPS1Q13098 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPS1Q13098 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPS1Q13098 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPS1Q13098 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPS1Q13098 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPS1Q13098 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPS1Q13098 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPS1Q13098 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPS1Q13098 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPS1Q13098 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPS1Q13098 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
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