Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BNIP1Q12981 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BNIP1Q12981 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BNIP1Q12981 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BNIP1Q12981 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BNIP1Q12981 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BNIP1Q12981 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BNIP1Q12981 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BNIP1Q12981 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BNIP1Q12981 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BNIP1Q12981 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BNIP1Q12981 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BNIP1Q12981 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BNIP1Q12981 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BNIP1Q12981 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BNIP1Q12981 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BNIP1Q12981 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BNIP1Q12981 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BNIP1Q12981 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BNIP1Q12981 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BNIP1Q12981 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNIP1Q12981 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNIP1Q12981 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNIP1Q12981 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNIP1Q12981 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNIP1Q12981 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNIP1Q12981 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BNIP1Q12981 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNIP1Q12981 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BNIP1Q12981 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BNIP1Q12981 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BNIP1Q12981 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BNIP1Q12981 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BNIP1Q12981 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BNIP1Q12981 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BNIP1Q12981 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BNIP1Q12981 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BNIP1Q12981 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BNIP1Q12981 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BNIP1Q12981 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BNIP1Q12981 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BNIP1Q12981 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BNIP1Q12981 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BNIP1Q12981 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BNIP1Q12981 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BNIP1Q12981 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BNIP1Q12981 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BNIP1Q12981 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BNIP1Q12981 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BNIP1Q12981 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BNIP1Q12981 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BNIP1Q12981 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BNIP1Q12981 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BNIP1Q12981 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BNIP1Q12981 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BNIP1Q12981 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BNIP1Q12981 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BNIP1Q12981 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BNIP1Q12981 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BNIP1Q12981 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BNIP1Q12981 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BNIP1Q12981 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BNIP1Q12981 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BNIP1Q12981 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BNIP1Q12981 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BNIP1Q12981 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BNIP1Q12981 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BNIP1Q12981 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BNIP1Q12981 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BNIP1Q12981 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BNIP1Q12981 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BNIP1Q12981 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BNIP1Q12981 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BNIP1Q12981 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BNIP1Q12981 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BNIP1Q12981 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BNIP1Q12981 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BNIP1Q12981 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BNIP1Q12981 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BNIP1Q12981 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BNIP1Q12981 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BNIP1Q12981 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BNIP1Q12981 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BNIP1Q12981 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BNIP1Q12981 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BNIP1Q12981 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BNIP1Q12981 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BNIP1Q12981 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BNIP1Q12981 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BNIP1Q12981 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BNIP1Q12981 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNIP1Q12981 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNIP1Q12981 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNIP1Q12981 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNIP1Q12981 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNIP1Q12981 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BNIP1Q12981 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BNIP1Q12981 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BNIP1Q12981 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BNIP1Q12981 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
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