Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXC1Q12948 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXC1Q12948 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXC1Q12948 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXC1Q12948 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXC1Q12948 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXC1Q12948 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXC1Q12948 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXC1Q12948 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXC1Q12948 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXC1Q12948 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXC1Q12948 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXC1Q12948 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXC1Q12948 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXC1Q12948 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXC1Q12948 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXC1Q12948 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXC1Q12948 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXC1Q12948 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXC1Q12948 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXC1Q12948 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXC1Q12948 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXC1Q12948 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXC1Q12948 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXC1Q12948 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXC1Q12948 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXC1Q12948 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXC1Q12948 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXC1Q12948 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXC1Q12948 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXC1Q12948 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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