Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C1Q12789 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C1Q12789 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C1Q12789 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C1Q12789 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C1Q12789 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C1Q12789 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C1Q12789 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C1Q12789 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C1Q12789 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C1Q12789 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C1Q12789 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C1Q12789 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C1Q12789 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3C1Q12789 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3C1Q12789 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3C1Q12789 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3C1Q12789 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3C1Q12789 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF3C1Q12789 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF3C1Q12789 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF3C1Q12789 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF3C1Q12789 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF3C1Q12789 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C1Q12789 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C1Q12789 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C1Q12789 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C1Q12789 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C1Q12789 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C1Q12789 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C1Q12789 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C1Q12789 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C1Q12789 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C1Q12789 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C1Q12789 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C1Q12789 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF3C1Q12789 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF3C1Q12789 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.2 ms