Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RASGEF1BQ0VAM2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RASGEF1BQ0VAM2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RASGEF1BQ0VAM2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASGEF1BQ0VAM2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RASGEF1BQ0VAM2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RASGEF1BQ0VAM2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASGEF1BQ0VAM2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASGEF1BQ0VAM2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASGEF1BQ0VAM2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASGEF1BQ0VAM2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASGEF1BQ0VAM2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RASGEF1BQ0VAM2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASGEF1BQ0VAM2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASGEF1BQ0VAM2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASGEF1BQ0VAM2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASGEF1BQ0VAM2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASGEF1BQ0VAM2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASGEF1BQ0VAM2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASGEF1BQ0VAM2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASGEF1BQ0VAM2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RASGEF1BQ0VAM2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASGEF1BQ0VAM2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASGEF1BQ0VAM2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASGEF1BQ0VAM2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RASGEF1BQ0VAM2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RASGEF1BQ0VAM2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASGEF1BQ0VAM2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASGEF1BQ0VAM2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASGEF1BQ0VAM2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASGEF1BQ0VAM2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASGEF1BQ0VAM2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RASGEF1BQ0VAM2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASGEF1BQ0VAM2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RASGEF1BQ0VAM2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASGEF1BQ0VAM2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASGEF1BQ0VAM2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASGEF1BQ0VAM2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RASGEF1BQ0VAM2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RASGEF1BQ0VAM2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RASGEF1BQ0VAM2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RASGEF1BQ0VAM2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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