Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
LMOD3Q0VAK6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
LMOD3Q0VAK6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
LMOD3Q0VAK6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
LMOD3Q0VAK6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
LMOD3Q0VAK6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
LMOD3Q0VAK6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
LMOD3Q0VAK6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
LMOD3Q0VAK6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
LMOD3Q0VAK6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
LMOD3Q0VAK6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
LMOD3Q0VAK6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
LMOD3Q0VAK6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
LMOD3Q0VAK6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
LMOD3Q0VAK6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
LMOD3Q0VAK6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
LMOD3Q0VAK6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
LMOD3Q0VAK6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
LMOD3Q0VAK6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
LMOD3Q0VAK6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
LMOD3Q0VAK6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
LMOD3Q0VAK6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
LMOD3Q0VAK6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
LMOD3Q0VAK6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
LMOD3Q0VAK6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
LMOD3Q0VAK6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
LMOD3Q0VAK6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
LMOD3Q0VAK6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
LMOD3Q0VAK6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
LMOD3Q0VAK6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
LMOD3Q0VAK6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
LMOD3Q0VAK6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
LMOD3Q0VAK6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
LMOD3Q0VAK6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
LMOD3Q0VAK6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
LMOD3Q0VAK6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
LMOD3Q0VAK6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
LMOD3Q0VAK6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
LMOD3Q0VAK6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
LMOD3Q0VAK6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
LMOD3Q0VAK6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
LMOD3Q0VAK6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
LMOD3Q0VAK6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
LMOD3Q0VAK6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
LMOD3Q0VAK6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
LMOD3Q0VAK6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
LMOD3Q0VAK6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
LMOD3Q0VAK6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
LMOD3Q0VAK6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
LMOD3Q0VAK6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
LMOD3Q0VAK6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
LMOD3Q0VAK6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
LMOD3Q0VAK6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
LMOD3Q0VAK6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
LMOD3Q0VAK6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
LMOD3Q0VAK6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
LMOD3Q0VAK6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
LMOD3Q0VAK6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
LMOD3Q0VAK6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
LMOD3Q0VAK6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
LMOD3Q0VAK6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
LMOD3Q0VAK6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
LMOD3Q0VAK6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
LMOD3Q0VAK6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
LMOD3Q0VAK6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
LMOD3Q0VAK6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
LMOD3Q0VAK6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
LMOD3Q0VAK6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
LMOD3Q0VAK6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
LMOD3Q0VAK6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
LMOD3Q0VAK6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
LMOD3Q0VAK6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
LMOD3Q0VAK6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
LMOD3Q0VAK6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
LMOD3Q0VAK6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
LMOD3Q0VAK6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
LMOD3Q0VAK6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
LMOD3Q0VAK6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
LMOD3Q0VAK6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
LMOD3Q0VAK6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
LMOD3Q0VAK6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
LMOD3Q0VAK6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
LMOD3Q0VAK6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
LMOD3Q0VAK6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
LMOD3Q0VAK6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
LMOD3Q0VAK6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
LMOD3Q0VAK6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
LMOD3Q0VAK6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
LMOD3Q0VAK6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
LMOD3Q0VAK6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
LMOD3Q0VAK6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
LMOD3Q0VAK6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
LMOD3Q0VAK6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
LMOD3Q0VAK6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
LMOD3Q0VAK6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
LMOD3Q0VAK6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
LMOD3Q0VAK6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
LMOD3Q0VAK6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
LMOD3Q0VAK6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
LMOD3Q0VAK6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms