Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFFO1Q0D2I5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IFFO1Q0D2I5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
IFFO1Q0D2I5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IFFO1Q0D2I5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFFO1Q0D2I5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFFO1Q0D2I5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFFO1Q0D2I5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFFO1Q0D2I5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFFO1Q0D2I5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFFO1Q0D2I5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFFO1Q0D2I5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFFO1Q0D2I5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFFO1Q0D2I5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFFO1Q0D2I5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFFO1Q0D2I5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFFO1Q0D2I5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFFO1Q0D2I5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFFO1Q0D2I5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFFO1Q0D2I5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFFO1Q0D2I5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms