Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUDPQ08623 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUDPQ08623 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUDPQ08623 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUDPQ08623 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUDPQ08623 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUDPQ08623 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUDPQ08623 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUDPQ08623 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PUDPQ08623 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PUDPQ08623 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PUDPQ08623 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUDPQ08623 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms