Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms