Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMX2Q04743 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMX2Q04743 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EMX2Q04743 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EMX2Q04743 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EMX2Q04743 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EMX2Q04743 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms