Protein–RNA interactions for Protein: Q03519

TAP2, Antigen peptide transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP2Q03519 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAP2Q03519 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TAP2Q03519 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TAP2Q03519 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TAP2Q03519 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TAP2Q03519 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAP2Q03519 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAP2Q03519 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAP2Q03519 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TAP2Q03519 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAP2Q03519 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAP2Q03519 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAP2Q03519 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAP2Q03519 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TAP2Q03519 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAP2Q03519 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAP2Q03519 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAP2Q03519 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAP2Q03519 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAP2Q03519 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAP2Q03519 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAP2Q03519 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAP2Q03519 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAP2Q03519 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAP2Q03519 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAP2Q03519 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAP2Q03519 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAP2Q03519 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAP2Q03519 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAP2Q03519 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAP2Q03519 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAP2Q03519 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAP2Q03519 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAP2Q03519 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAP2Q03519 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAP2Q03519 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAP2Q03519 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAP2Q03519 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAP2Q03519 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAP2Q03519 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAP2Q03519 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAP2Q03519 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAP2Q03519 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAP2Q03519 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAP2Q03519 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAP2Q03519 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAP2Q03519 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAP2Q03519 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAP2Q03519 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms