Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NUCB1Q02818 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NUCB1Q02818 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NUCB1Q02818 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NUCB1Q02818 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NUCB1Q02818 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NUCB1Q02818 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NUCB1Q02818 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NUCB1Q02818 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NUCB1Q02818 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUCB1Q02818 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUCB1Q02818 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUCB1Q02818 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUCB1Q02818 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUCB1Q02818 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUCB1Q02818 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUCB1Q02818 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
NUCB1Q02818 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUCB1Q02818 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUCB1Q02818 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NUCB1Q02818 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NUCB1Q02818 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NUCB1Q02818 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NUCB1Q02818 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NUCB1Q02818 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NUCB1Q02818 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NUCB1Q02818 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
NUCB1Q02818 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NUCB1Q02818 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NUCB1Q02818 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NUCB1Q02818 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NUCB1Q02818 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NUCB1Q02818 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NUCB1Q02818 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NUCB1Q02818 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NUCB1Q02818 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
NUCB1Q02818 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NUCB1Q02818 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NUCB1Q02818 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUCB1Q02818 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUCB1Q02818 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUCB1Q02818 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUCB1Q02818 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUCB1Q02818 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUCB1Q02818 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUCB1Q02818 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUCB1Q02818 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUCB1Q02818 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUCB1Q02818 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUCB1Q02818 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUCB1Q02818 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUCB1Q02818 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
NUCB1Q02818 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUCB1Q02818 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUCB1Q02818 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUCB1Q02818 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUCB1Q02818 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUCB1Q02818 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUCB1Q02818 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NUCB1Q02818 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NUCB1Q02818 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NUCB1Q02818 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NUCB1Q02818 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUCB1Q02818 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUCB1Q02818 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUCB1Q02818 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUCB1Q02818 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUCB1Q02818 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUCB1Q02818 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUCB1Q02818 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUCB1Q02818 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUCB1Q02818 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUCB1Q02818 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUCB1Q02818 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUCB1Q02818 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUCB1Q02818 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUCB1Q02818 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUCB1Q02818 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUCB1Q02818 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUCB1Q02818 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUCB1Q02818 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUCB1Q02818 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
NUCB1Q02818 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUCB1Q02818 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUCB1Q02818 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUCB1Q02818 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUCB1Q02818 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUCB1Q02818 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUCB1Q02818 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUCB1Q02818 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUCB1Q02818 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUCB1Q02818 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUCB1Q02818 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUCB1Q02818 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUCB1Q02818 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUCB1Q02818 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUCB1Q02818 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUCB1Q02818 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NUCB1Q02818 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NUCB1Q02818 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms