Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPEQ02224 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPEQ02224 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPEQ02224 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CENPEQ02224 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CENPEQ02224 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CENPEQ02224 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CENPEQ02224 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CENPEQ02224 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CENPEQ02224 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CENPEQ02224 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CENPEQ02224 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CENPEQ02224 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPEQ02224 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPEQ02224 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPEQ02224 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPEQ02224 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPEQ02224 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPEQ02224 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPEQ02224 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPEQ02224 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPEQ02224 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPEQ02224 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPEQ02224 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPEQ02224 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPEQ02224 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPEQ02224 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPEQ02224 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPEQ02224 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPEQ02224 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPEQ02224 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPEQ02224 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPEQ02224 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPEQ02224 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPEQ02224 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPEQ02224 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPEQ02224 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPEQ02224 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPEQ02224 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPEQ02224 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPEQ02224 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPEQ02224 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPEQ02224 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPEQ02224 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPEQ02224 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPEQ02224 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPEQ02224 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPEQ02224 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPEQ02224 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPEQ02224 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPEQ02224 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms