Protein–RNA interactions for Protein: Q01664

TFAP4, Transcription factor AP-4, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP4Q01664 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TFAP4Q01664 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TFAP4Q01664 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TFAP4Q01664 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TFAP4Q01664 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TFAP4Q01664 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TFAP4Q01664 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TFAP4Q01664 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TFAP4Q01664 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TFAP4Q01664 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TFAP4Q01664 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TFAP4Q01664 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TFAP4Q01664 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TFAP4Q01664 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TFAP4Q01664 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TFAP4Q01664 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TFAP4Q01664 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TFAP4Q01664 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TFAP4Q01664 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TFAP4Q01664 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TFAP4Q01664 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TFAP4Q01664 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TFAP4Q01664 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TFAP4Q01664 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TFAP4Q01664 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TFAP4Q01664 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TFAP4Q01664 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TFAP4Q01664 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TFAP4Q01664 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TFAP4Q01664 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TFAP4Q01664 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TFAP4Q01664 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TFAP4Q01664 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TFAP4Q01664 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TFAP4Q01664 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TFAP4Q01664 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TFAP4Q01664 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TFAP4Q01664 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TFAP4Q01664 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TFAP4Q01664 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TFAP4Q01664 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TFAP4Q01664 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TFAP4Q01664 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TFAP4Q01664 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TFAP4Q01664 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TFAP4Q01664 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TFAP4Q01664 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TFAP4Q01664 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TFAP4Q01664 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TFAP4Q01664 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TFAP4Q01664 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TFAP4Q01664 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TFAP4Q01664 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TFAP4Q01664 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TFAP4Q01664 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TFAP4Q01664 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TFAP4Q01664 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TFAP4Q01664 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TFAP4Q01664 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TFAP4Q01664 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TFAP4Q01664 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TFAP4Q01664 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TFAP4Q01664 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TFAP4Q01664 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TFAP4Q01664 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TFAP4Q01664 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TFAP4Q01664 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TFAP4Q01664 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TFAP4Q01664 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TFAP4Q01664 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TFAP4Q01664 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TFAP4Q01664 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TFAP4Q01664 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TFAP4Q01664 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TFAP4Q01664 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TFAP4Q01664 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TFAP4Q01664 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TFAP4Q01664 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TFAP4Q01664 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TFAP4Q01664 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TFAP4Q01664 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TFAP4Q01664 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TFAP4Q01664 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TFAP4Q01664 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TFAP4Q01664 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TFAP4Q01664 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TFAP4Q01664 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TFAP4Q01664 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TFAP4Q01664 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TFAP4Q01664 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TFAP4Q01664 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TFAP4Q01664 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TFAP4Q01664 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TFAP4Q01664 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TFAP4Q01664 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TFAP4Q01664 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TFAP4Q01664 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TFAP4Q01664 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TFAP4Q01664 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TFAP4Q01664 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms