Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SCN7AQ01118 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SCN7AQ01118 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SCN7AQ01118 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SCN7AQ01118 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.45
SCN7AQ01118 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.45
SCN7AQ01118 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
SCN7AQ01118 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
SCN7AQ01118 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SCN7AQ01118 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SCN7AQ01118 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SCN7AQ01118 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SCN7AQ01118 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SCN7AQ01118 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SCN7AQ01118 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SCN7AQ01118 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SCN7AQ01118 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SCN7AQ01118 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
SCN7AQ01118 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
SCN7AQ01118 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
SCN7AQ01118 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
SCN7AQ01118 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SCN7AQ01118 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SCN7AQ01118 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SCN7AQ01118 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SCN7AQ01118 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SCN7AQ01118 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SCN7AQ01118 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SCN7AQ01118 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SCN7AQ01118 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SCN7AQ01118 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SCN7AQ01118 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SCN7AQ01118 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SCN7AQ01118 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SCN7AQ01118 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
SCN7AQ01118 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SCN7AQ01118 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SCN7AQ01118 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SCN7AQ01118 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SCN7AQ01118 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SCN7AQ01118 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SCN7AQ01118 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SCN7AQ01118 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SCN7AQ01118 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SCN7AQ01118 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SCN7AQ01118 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SCN7AQ01118 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SCN7AQ01118 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
SCN7AQ01118 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SCN7AQ01118 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SCN7AQ01118 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SCN7AQ01118 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SCN7AQ01118 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCN7AQ01118 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCN7AQ01118 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCN7AQ01118 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCN7AQ01118 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCN7AQ01118 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCN7AQ01118 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCN7AQ01118 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCN7AQ01118 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCN7AQ01118 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCN7AQ01118 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
SCN7AQ01118 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
SCN7AQ01118 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SCN7AQ01118 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SCN7AQ01118 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SCN7AQ01118 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SCN7AQ01118 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SCN7AQ01118 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SCN7AQ01118 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SCN7AQ01118 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SCN7AQ01118 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SCN7AQ01118 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SCN7AQ01118 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SCN7AQ01118 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SCN7AQ01118 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SCN7AQ01118 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SCN7AQ01118 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SCN7AQ01118 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SCN7AQ01118 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SCN7AQ01118 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SCN7AQ01118 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SCN7AQ01118 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SCN7AQ01118 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SCN7AQ01118 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SCN7AQ01118 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SCN7AQ01118 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCN7AQ01118 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCN7AQ01118 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SCN7AQ01118 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCN7AQ01118 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCN7AQ01118 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCN7AQ01118 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCN7AQ01118 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SCN7AQ01118 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SCN7AQ01118 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
SCN7AQ01118 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SCN7AQ01118 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SCN7AQ01118 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms