Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRCDQ00LT1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms